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上海德济医院生酮饮食疗法(KDTs)是用于难治性癫痫儿童和成人的公认的非药物治疗方法。自1921年以来，经典的生酮饮食疗法常被用于癫痫治疗，上海德济医院于成立之初设立生酮饮食治疗单元，截止至2019年已接诊难治性癫痫患者近3000人。

对于药物难治性癫痫且适合手术治疗的患者，科室提供科学、全面的外科手术治疗。除常规开展额叶、颞叶、顶叶、枕叶癫痫病灶切除手术、半球/多脑叶切除术、半球/多脑叶离断术外，近年来还开展了岛叶及中央区、语言功能区癫痫病灶切除手术，功能区病灶唤醒麻醉切除手术，深部小病灶开展了SEEG引导下的热凝手术。对于部分多灶性的或者全面性癫痫开展了胼胝体全段切开术，迷走神经刺激器手术(VNS)，脑深部电刺激手术(DBS)。